Įvairiuose šaltiniuose (NARHA Standarts & Accreditation Manual, 2005; AHA, 2003; Chambers, 2002; Sechrist, 2000; Bukovec, 2002;  Pesce, 2000) nurodomos bendros hipoterapijos indikacijos vaikams ir suaugusiems:

•     cerebrinis paralyžius,
•      raumenų distrofija,
•      sulėtėjęs raidos vystymasis,
•      protinis atsilikimas,
•      Dauno sindromas,
•      įgimta stuburo išvarža,
•      autizmas,
•      ortopedinės ligos (laikysenos sutrikimas, skoliozė, hipermobilumas),
•      mokymosi ir kalbos sutrikimai,
•      išsėtinė sklerozė,
•       sensorikos sutrikimai,
•       smegenų traumos,
•       potrauminės būklės,
•       aklumas,
•      psichinės ligos (šizofrenija, neurozė, stresas, depresija, asmenybės sutrikimai, elgesio ir emocijų problemos ir kt.),
•       amputacija,
•       reumatoidinis artritas.